Ewangelików osiedlano na Sejneńszczyźnie za czasów pruskich. Do Sejn zjeżdżali się na różne uroczystości. Mieszkali wtedy w domach współwyznawców. W innych dniach kościół był zamknięty. W okresie międzywojennym mieszkała w Sejnach szanowana rodzina Mittagów. Jan Mittag - ojciec - był pastorem i nauczycielem. Był też pierwszym burmistrzem miasta po I wojnie światowej. Po II wojnie proboszcz parafii katolickiej przejął zbór na wojskowy kościół garnizonowy. Po likwidacji garnizonu kościół zmienił swoje przeznaczenie. Dziś kościół poewangelicki służy w czasie rekolekcji.
Kościół ewangelicki
8 stycznia 2011 16:31
Kościół ewangelicki zbudowany został w 1844 r. na ówczesnej ulicy Węgierskiej. Liczebność parafii ewangelicko-augsburskiej w Sejnach wynosiła: w latach 1922-1923 - 200, w roku 1930 - 350, w roku 1935 - 350, w roku 1940 - 400.